Sinopsis:
Un misterio se cierne en el Museo de Historia Natural cuando las exhibiciones y artefactos empiezan ha ser cambiados de lugar y dañados, y una especie de insecto humanoide es vislumbrado, y le toca a Scooby-Doo y sus amigos humanos para averiguar lo que está pasando.
Scooby, Shaggy, Daphne, Velma y Fred comienzan en el vestíbulo principal del Museo. La acción se realiza con el ratón, siendo el + cursor un dedo que se puede mover a la dirección deseada, y cuando este cambia a una mano en posición de querer recoger algo se puede recoger o mover objetos, o hacer clic en un elemento para ver animaciones. En la parte inferior de la pantalla se encuentra la camioneta de Misterio; si haces clic en ella, aparecerá una caja de Scoobygalletas con las que sobornar a Scooby y Shaggy cuando están actuando cobardemente, un icono de los auriculares para ver las opciones de sonido, y un icono de la puerta para salir del juego.
Tu trabajo consiste en recoger pistas al escuchar cintas (convenientemente dejadas por ahí!) y resolver puzzles. A medida que vas resolviendo cada puzzle recibes un artículo que usted deposita en archivos debajo de las imágenes de cinco empleados del museo. Con este método, usted es capaz de eliminar sospechosos, uno por uno, hasta llegar al culpable. Los puzzles incluyen deslizar y emparejar azulejos con dibujos, completar los conjuntos de patrones de rock, recordar qué botones de la máquina de helados se corresponden con qué sabores, y tres más. Las habilidades de reconocimiento de patrones y el pensamiento lógico se destacan a lo largo del juego, y pueden ser bastante difíciles en su nivel más difícil con la intención de atraer a los niños mayores también. También está disponible en este disco diferentes imprimibles de Scooby-Doo, incluyendo carteles, laberintos y crucigramas.