El juego se inicia al final de la "Guerra de las Focas" (véase el segundo "Super Robot Wars Alfa") con la tripulación del Ra calium vieniendo de una enorme estructura similar a un anillo de un campo de asteroides. Este Crossgate (como se le llama más tarde) hace que el Excelion (que estalló a finales del primer juego Alfa) y su tripulación reaparezcan, aunque han pasado dos años desde el final del + primera alfa. El juego presenta un resumen de todos los eventos de los 3 juegos anteriores y en función de el personaje del jugador elegido al inicio del juego luego, se iniciará la historia a partir de el. A medida que se avanza la historia los Alpha se encuentran luchando contra el Registro Akáshico para detener la destrucción completa de la galaxia que se conoce como "Apocalypsis".
Sinopsis:
El juego se inicia al final de la "Guerra de las Focas" (véase el segundo "Super Robot Wars Alfa") con la tripulación del Ra calium vieniendo de una enorme estructura similar a un anillo de un campo de asteroides. Este Crossgate (como se le llama más tarde) hace que el Excelion (que estalló a finales del primer juego Alfa) y su tripulación reaparezcan, aunque han pasado dos años desde el final del + primera alfa. El juego presenta un resumen de todos los eventos de los 3 juegos anteriores y en función de el personaje del jugador elegido al inicio del juego luego, se iniciará la historia a partir de el. A medida que se avanza la historia los Alpha se encuentran luchando contra el Registro Akáshico para detener la destrucción completa de la galaxia que se conoce como "Apocalypsis".
