Sinopsis:
El protagonista del primer juego, Leopard Chateau-Lyon, se encuentra vagando en el bosque, sin memoria de su pasado, excepto su nombre. Es capturado por dos mujeres guerreras y es llevado a su reina. Parece que sólo hay mujeres en este país, cuando el héroe dice que es un hombre, la reina se regocija, y empieza a hablarle de una antigua leyenda que profetiza la llegada de una criatura llamada hombre, + que salvará a su país de la despiadada reina del país vecino. El héroe tiene que demostrar que es digno de su condición heroica y derrotar a las fuerzas enemigas que amenazan el país.
"Wonpara Wars II" sigue el mismo principio que el anterior: Derrotar al ejército enemigo en batallas parecidas al ajedrez, mira la escena que continua la narración de la trama, y pasar a la siguiente etapa. Las reglas para el propio juego de mesa son más complejas. Hay nuevas piezas, tomadas del ajedrez occidental (caballero), así como los originales (Ninja). Las reglas difieren de las variantes del ajedrez conocidas de varias maneras (cofres del tesoro pueden cambiar al azar las reglas de movimiento de una pieza, muchos tipos de piezas pueden moverse sólo hacia adelante, etc.) Las piezas también se diferencian por género: Caballeros parecidos a hombres, obispos parecidos a mujeres, etc... Cada ejército tiene una pieza "jefa", que representa al héroe y al general enemigo, correspondientemente. Una vez que un general es capturado, la batalla está ganada. También hay piezas enemigas únicas, una para cada batalla.
Al igual que el primer juego, la captura de una pieza enemiga se acompaña de imágenes hentai. Puesto que hay piezas masculinas y femeninas, las diferentes imágenes se muestran en función de la pieza jugador que ha realizado la captura.