Sinopsis:
Amami City es una megalópolis japonesa de un futuro próximo. En esta gran ciudad, cada casa tiene un ordenador y todos los equipos están conectados a una red grande. El flujo de información está siendo controlado por el gobierno y las empresas de software crean grandes redes virtuales. Un miembro de dieciocho años de edad de un grupo de hackers llamado Spookies y sus acompañantes acceden a una de + estas redes - una ciudad virtual llamada Paradigm-X, creada por Algon Soft. Sin embargo, se produce un accidente durante la piratería, y un misterioso demonio que se hace llamar Nemissa emerge. Los Spookies deben encontrar la verdadera razón detrás de la llegada de Nemissa, y se enfrentan a una oscura organización llamada Sociedad Fantasma, quienes contratan a invocadores de demonios.
"Soul Hackers" es similar en sus temas, estructura y modo de juego a su predecesor, así como a la principal serie "Shin Megami Tensei". Situado en un entorno cyberpunk futurista, el juego contiene muchos elementos característicos, como dos tipos de armas (espadas y armas de fuego) para el héroe principal, una compañera que pueda aprender y lanzar hechizos mágicos, y un grupo de seis combatientes activos, de los cuales cuatro son demonios. Al igual que en muchos otros Megami Tensei, el jugador puede comunicarse con los demonios encontrados al azar y reclutarlos en el grupo con la selección de las opciones de diálogo correspondientes. Estos demonios también pueden fusionarse entre sí para crear los más poderosos demonios.
El sistema de fidelización de la anterior entrega vuelve, pero sin embargo, esta entrega hace que sea más fácil elevar el nivel de lealtad de un demonio. Al llevar a un demonio a las batallas y haciendo que realice varias veces una acción que le gusta (indicando por sus comentarios las elecciones del jugador), el jugador poco a poco puede hacer que sea totalmente controlable y obediente. El ataque y la magia de los demonios se elevan junto con sus niveles de fidelidad.
Nuevo en esta entrega es una capacidad limitada para fusionar los demonios fuera de los lugares de fusión específicos, mediante el uso de su computadora. El jugador también puede comprar e instalar software en este equipo, que tiene una variedad de funciones, desde la ayuda en el combate y cartografía a la posibilidad de guardar la partida en cualquier parte de la mazmorra.
