Sinopsis:
Dos hermanas, Ai y Yuuko, han tomado diferentes caminos en la vida. Yuuko ha sido arrebatada por una banda misteriosa. Ai está decidida a salvarla de las garras de la delincuencia. En una ciudad habitada aparentemente sólo por mujeres e invadida por trabajadores dementes, bandas de motoristas y criminales surtidos, Ai y sus amigas Chika y Makoto deciden formar equipo con el fin de restaurar el mundo a la + normalidad de nuevo.
¨Ane-san¨ es lo que comúnmente se llama beatem up, es decir, un juego de lucha que permite un movimiento limitado a través de un entorno de desplazamiento lateral. El jugador puede elegir controlar una gran variedad de mujeres luchadoras. En un principio, sólo Ai, Chika, y Makoto son seleccionables. Ai es el personaje versátil y equilibrado, Chika es rápida y frágil, mientras que Makoto es muy fuerte, pero lenta. Más adelante en el juego, otros personajes son desbloqueados. Cada luchadora tiene una barra de puntos de salud, que puede ser restaurada a partir de elementos de curación dispersos a través de los niveles. Una vez que un personaje muere, el jugador puede continuar jugando con el otro.
El jugador por lo general avanza a través de las etapas de desplazamiento lateral, limpiando cada pantalla de enemigos antes de poder seguir caminando hacia la derecha. Cada chica tiene sus patadas y puñetazos estándar, y saltos a su disposición, así como movimientos especiales, una para cada chica. Las etapas culminan con batallas contra jefes (por lo general dos por etapa).
Entre las etapas, el jugador puede ir de compras. Una gran variedad de artículos está disponible. Algunos mejoran el rendimiento de las chicas, pero la mayoría sirven puramente como efecto visual - la sala que el jugador visita entre las etapas cambia su apariencia dependiendo de los elementos que el jugador ha comprado.
También disponible entre las etapas (y como un modo de juego ¨versus¨ por separado) hay un minijuego, en el que el jugador(es) tiene que pulsar rápidamente los botones con el fin de hacer que la chica controlable haga una mueca horrible, con la misión de superar a la del oponente en fealdad y velocidad de ejecución.