Sinopsis:
En el planeta Zi, muy lejos en el universo, hay tanto habitantes buenos como malvados. Para hacerse con el control del planeta, utilizan robots mecanizados llamados Zoids para luchar por el control del mundo. Durante un experimento, guerreros Zoids de diferentes épocas, el Siglo Caótico y el Nuevo Siglo, chocan. Los jugadores toman el control del guerrero Zoids Zeru, que quiere restaurar el caos con la + ayuda de sus amigos Van, Fiona y Bit Cloud. Hay diferentes tipos de Zoids para elegir, y cada uno de ellos se pueden actualizar y personalizar.
Zeru controla a un robot sencillo y tiene que participar en torneos para ganar dinero y recoger otros nuevos. Tiene la oportunidad de conocer a Juno que es secuestrada y un hombre llamado Dr. T le habla acerca de la fusión que trajo pasado, presente y futuro juntos. Luchando en batallas por turnos (con un máximo de duelos seis a seis), el jugador recoge cristales dejados por Zoids derrotados que se pueden convertir en nuevos visitando el laboratorio en una de las muchas ciudades. Allí, los robots se pueden actualizar también en diferentes áreas, con elementos defensivos y ofensivos, tanto para el combate de larga distancia como el cuerpo a cuerpo. Antes de cada combate los jugadores definen el comando cubierta. Esto afecta a todo el equipo, que influye en el dinero en efectivo, piezas rescatadas o que ofrece las posibilidades de fusionar todos los Zoids en una gran criatura. Cada vez ofrece al jugador atacar, esperar (y regenerar) o usar un artículo. Algunos Zoids se acompañan de organoides, amigos robot, que pueden fundirse en el Zoid principal para capacidades mejoradas.
El principal modo historia se desarrolla en 40 aldeas con 151 Zoids a recoger. También hay un modo de desafío con batallas consecutivas, cada vez más difíciles, y multijugador a través del cable de enlace. A excepción de la lucha, este modo también se puede utilizar para Zoids y partes comerciales.
