Existen 4 jefes secretos en el juego a los que te puedes enfrentar al haber completado los mundo y conseguir las copas del coliseo,Kurt Zisa en el mundo de aladdin,Espectro en el mundo de peter pan,el Titan de Hielo en el coliseo de hercules y por ultimos nada menos que Sefirot,tambien en el coliseo.

como bien a dicho riku en la version europea hay 4 jefes secretos pero en la japonesa tambien nos podemos enfrentar a un mienbro de la organizacion XIII asi como en el dos final mix se puede enfrentar a todos los de la organizacion