¨Magnetis¨ es un juego de puzle de caída de bloques en el que el jugador tiene que emparejar los imanes. Una máquina escupe bloques de tres tipos: los imanes izquierdos, bloques conductores e imanes derechos. La tarea del jugador es eliminar los bloques que quedan uniendo los imanes izquierdos con los imanes derechos. Bloques caen desde la máquina hasta una cinta transportadora que el jugador puede mover hacia la izquierda y hacía la derecha. Al hacerlo, el jugador hace emparejamientos entre los bloques en la cinta transportadora y los que caen. Los imanes pueden tener diferentes colores y sólo son compatibles con los imanes del mismo color. Si se combinan imanes de dos colores diferentes se crean bloques defectuosos. Estos sólo pueden ser removidos mediante la destrucción de los bloques cercanos. Es posible crear combos mediante la destrucción de varias líneas en una fila y así el jugador consigue puntos multiplicados. El juego se acaba cuando los bloques alcanzan la parte superior de la pantalla. Hay tres modos de juego diferentes en un solo jugador. El Modo Normal consiste en sobrevivir el mayor tiempo posible, el modo de Ataque Temporal se trata de lograr la puntuación más alta en 165 segundos y en el modo Ataque de Bloques el jugador sólo tiene acceso a 100 bloques y tiene que sacar el máximo provecho de ellos. El juego cuenta con modo multijugador para hasta cuatro jugadores en la misma máquina. Hay un Modo Batalla que es un modo competitivo en el que cada jugador tiene su propio campo de juego, mientras que también hay un Modo Cooperativo en el que dos jugadores se ayudan el uno al otro en el mismo campo de juego.