Far Cry 3 regresa a su clásica temática de isla tropical, similar al del primer título. El jugador asumirá el papel de Jason Brody, un turista que quedó varado en una serie de islas que han tenido conflictos locales violentos por muchos años. Jason fue separado de su novia y durante su búsqueda por encontrarla, los desarrolladores han declarado que tendrá que lidiar con un elenco de personajes en su mayoría inestables que han estado atrapados en la isla desde hace largo tiempo. En la breve demostración, Jason interactúa con un personaje llamado Vaas (doblado por Michael Mando), quien le da un pequeño discurso acerca de la naturaleza de la locura antes de tratar de ahogar a Jason mediante el anclaje de bloque de cemento y tirarlo a una piscina natural de agua que claramente ha sido utilizado para éste próposito.5 Detalles de la historia de Jason aún no han sido reveladas, además del hecho de que los desarrolladores han declarado que posee un conjunto de habilidades fuertes tanto de luchador como de sobreviviente que le dan la oportunidad de pelear en situaciones desesperadas que constantemente se encontrará durante el juego. Los desarrolladores también han declarado que la adaptación será de realismo e intensidad y un intento de provocar un sentimiento visceral y de constante peligro.