La historia se desarrolla antes de la investigación de Kira representada en el manga original. El jugador asume el papel de un agente del FBI novato que es noqueado durante una investigación encubierta. El jugador se despierta en un extraño hotel y trata de escapar a pesar de las varias trampas establecidas en todo el edificio. El genio detective L ofrece ayuda en la fuga a través de una PDA de ficción en el juego, y el jugador se alimenta de la información de L que se recoge en todo el hotel y fuera. El software también incluye un modo separado ¨L Communicator¨ en la que los usuarios pueden hacerse amigos de L dándole dulces. Si el usuario tiene éxito en hacerse amigo de L, L ¨hablarᨠcon el usuario a través de la voz.