Este juego es la secuela de "Gundam: The Battle Master". Heero Yuy, el piloto de un Mobile Suit Gundam Wing está en una misión para destruir a los enemigos Mobile Suits restantes, que están bajo el mando de Treize Khushrenada, con el fin de evita que se inicie una guerra. En el modo historia, Heero puede pilotar cualquiera de los Mobile Suits disponibles para combatir a sus enemigos. Cada Suit tiene su propio conjunto de movimientos especiales y un super ataque. Algunos de los ataques especiales basados en armamento usan municiones que eventualmente pueden agotarse. El súper ataque sólo se puede utilizar 3 veces durante cada pelea. Cada Suit también tiene propulsores que se pueden utilizar para volar en el aire un poco. En el lado defensivo, los jugadores pueden esquivar ataques y también pueden utilizar un escudo de haz que se puede utilizar para proteger al jugador de los ataques de proyectil. Los Mobile Suits vienen con 3 barras de vida totales y las peleas se deciden al tratar de agotarse todas las barras de vida de un Mobile Suit enemigo. El juego también contiene un modo versus de 2 jugadores. Las opciones permiten al jugador elegir su nivel de dificultad y también establecer el temporizador durante un combate.