En este cuarto episodio de las aventuras del némesis de Mario, el avaricioso Wario lee en un periódico acerca de un tesoro secreto perdido en una pirámide. Eso es suficiente para Wario: él salta en su coche, entra en la pirámide, y luego el jugado pasa a tomar el control de él. Wario es un juego de plataformas clásico con un giro: algunos enemigos en realidad no te hacen daño, pero te cambian en diversas formas, como Wario flotante, Wario zombie, o Wario murcielago.