Sinopsis:
La historia trata de un héroe y una joven heroína en su intento de evitar que Dark Lord de Glavie (Shadow Knight en su versión japonesa) y su ayudante, el hechicero Julius, destruyan el Árbol de Maná, lo que condenaría al mundo.
La jugabilidad es similar a la del primer Zelda: el mundo se ve desde una cámara cenital, dividida en varias pantallas a las que el personaje principal puede ir + accediendo al moverse al extremo de arriba, abajo, izquierda o derecha de la pantalla actual. El jugador puede interactuar con personajes dentro de los poblados consiguiendo así información y comprado o vendiendo objetos y equipo. Es posible combatir con diversos enemigos para lograr experiencia, dinero u objetos. Dentro de las zonas de mazmorra o dungeon, nos podemos encontrar con varios desafíos en forma de puzzles que deben ser resueltos en orden para poder avanzar. El jugador puede guardar la partida en cualquier momento.
Siguiendo la tradición de los jrpg, el personaje principal posee varias estadísticas, como los puntos de vida(HPs), fuerza y aguante, que pueden ser mejoradas mediante la subida de niveles de experiencia. Los hechizos, que consumirán MPs, pueden ser usados para curarse a uno mismo o dañar a los enemigos. Estos conjuros solo pueden ser obtenidos en algunos lugares o a través de otros personajes durante algunos momentos de la trama. Además, el personaje posee una barra de poder que afecta a la fuerza de su ataque. La velocidad a la que aumenta depende directamente de la característica de Voluntad (Will). La barra se incrementa por si misma lentamente a través del tiempo, pero una vez que el personaje ataca, es vaciada. Cuando la barra está completamente llena y el personaje ataca, se realiza un ataque especial. Este sistema se utilizará en varios títulos de la saga Mana.
En ocasiones, un personaje no jugador acompañará al protagonista en la historia, pudiendo realizar varias acciones que ayuden al personaje en su aventura. El juego permite matar personajes en los poblados, algo que aún hoy es raro de encontrar en el género de los jrpg.