Sinopsis:
La acción tiene lugar durante 6 días en Nueva York, en 1997. El incidente empieza el 24 de diciembre y termina el 30.
Aya Brea, una novata de la Policía de Nueva York de 25 años, está asistiendo a una presentación de ópera en el Carnegie Hall de Nueva York durante Nochebuena cuando repentinamente, en el momento en que la actriz principal comienza su aria, casi todas las personas en el teatro + estallan en llamas. Aya, el hombre que la acompañaba, y una actriz en escena son las únicas personas en el edificio entero que quedan ilesas. Aya se enfrenta a la actriz, Melissa Pearce, quien lucha contra ella con unos extraños poderes, y antes de desaparecer tras el escenario Pearce menciona enigmáticamente que las mitocondrias en las células de Aya necesitan más tiempo para desarrollarse. Después de su encuentro con la actriz, Aya siente un cambio en su cuerpo: una extraña sensación de intenso calor junto con unos nuevos poderes. Aya explora entre bastidores buscando a Pearce y encuentra el diario de Melissa en un camerino. Descubre las ansias de la actriz para interpretar el papel principal de la obra y un recital en Central Park, y su adicción a cierta medicación especial, porque últimamente se estaba sintiendo enferma debido a que repentinamente su temperatura corporal aumentaba sin razón alguna. En la última habitación de la parte trasera del teatro, Aya se encuentra con Pearce tocando el piano, que súbitamente muta en un especie de monstruo flotante. Pearce declara que ella ya no es más Melissa Pearce, sino "Eve", un ser infernal con un solo objetivo: liberar a todas las mitocondrias existentes. Tras una extraña visión de Aya, Eve se escapa por el sistema de alcantarillado, pero Aya se enfrenta otra vez con ella después de derrotar a una gran variedad de criaturas mutantes, llamadas NMCs, o Criaturas Neo-Mitocondriales. Por el camino, Aya cree ver al fantasma de una niña que le es familiar. Eve dice que va a darle más tiempo a Aya para que evolucione y escapa mientras Aya lucha contra un enorme cocodrilo mutante. Todo esto se desarrolla en una multitud de escenarios llenos de suspense e imaginación.
Tras una incómoda rueda de prensa en la comisaría referente a los eventos de Carnegie Hall, Aya va a ver a un científico experto en mitocondrias al Museo de Historia Natural junto con Daniel, su compañero en el Departamento de Policía. El doctor Hans Klamp les provee de diversa información científica sobre las mitocondrias aparentemente inútil, pero Aya y Daniel sospechan que Klamp les oculta algo, sobre todo al ver que reacciona de manera extraña cuando mencionan a Eve. Al volver a la comisaría, el comisario Baker les informa que Eve está en el anfiteatro de Central Park, donde Melissa Pearce iba a dar un recital. Daniel recuerda que su exmujer y su hijo iban a ir a verla y, sin dudarlo, él y Aya se dirigen rápidamente hacia allí para rescatarlos. Al llegar, Aya tiene que entrar sola en el parque porque Daniel corre riesgo de arder si entra en el radio de influencia mitocondrial de Eve. Tras abrirse paso por el parque luchando contra animales mutados, Aya logra llegar al anfiteatro, pero ya es tarde para detener a Eve, quien usa su poder para que toda la audiencia se licúe en una gelatinosa masa anaranjada.
Aya va tras Eve, que huye del anfiteatro, y según avanza por el parque vuelve a tener extrañas visiones de una sala de hospital, y ve de nuevo a la niña fantasma, que identifica como Maya, su difunta hermana pequeña. Finalmente alcanza a Eve, y ambas terminan luchando en un carruaje, donde Eve le recrimina a Aya que esté del lado de esos patéticos humanos y no se una a ella. Finalmente, el caballo, desbocado y llameante por culpa de Eve, cae muerto, el carruaje se estrella y Aya queda inconsciente.
A continuación, seguimos con Daniel por un breve período. Daniel encuentra a su hijo, Ben, quien logró escapar del anfiteatro, mientras la exmujer de Daniel, Lorraine, ha sido absorbida por la masa gelatinosa.