Sinopsis:
Es el año 2058. Después de un evento conocido como el Despertar, la magia ha vuelto al mundo. Chamanes y elfos nativos americanos reclamaron una vasta zona conocida como Salish-Shidhe, situada alrededor de la ciudad libre de Seattle. Un pequeño equipo de Shadowrunners - mercenarios que trabajan para las corporaciones poderosas - es atacado brutalmente en el desierto. La masacre es capturada en video y + se difunde en las noticias. Uno de los Shadowrunners muertos, Michael, tenía un hermano llamado Josué. Al llegar a Seattle, Joshua comienza a investigar la muerte de su hermano. Debe averiguar quién mató a Michael, y lo que era la naturaleza del trabajo de un Shadowrun.
Shadowrun es un juego de rol orientado a la acción basado en el RPG de lápiz y papel de FASA. Es completamente diferente de la adaptación de SNES de la misma licencia. En el comienzo del juego, el jugador selecciona una clase de características para Joshua, elegiendo entre samurai, Decker (mercenario), o un chamán, que se especializan en el combate, el mundo cibernético, y la magia, respectivamente. El juego es bastante abierto, dejando que el jugador se desplace con Joshua a través de áreas generales predominantemente urbanas, hablando con los personajes y recogiendo información.
El jugador puede contratar a personajes para unirse al grupo, sin embargo, sólo un personaje puede ser controlado directamente por el jugador. El combate es basado en la acción, los personajes pueden usar armas cuerpo a cuerpo, armas de fuego (con munición consumible) o magia. El "Karma", un equivalente de los puntos de experiencia, se otorga por matar a los enemigos y completar misiones. Los puntos Karma pueden ser asignados por el jugador manualmente para aumentar los parámetros del personaje.
Ciertos personajes también pueden entrar en Matrix, una red virtual que se accede a través de cyberterminales. La navegación por Matrix se hace desde una perspectiva en tercera persona vista desde el detrás del hombro. El jugador puede mejorar y personalizar el Cyberdeck de Joshua, lo que le permite hackear a través de los sistemas de cifrado más fácilmente y almacenar los datos obtenidos de Matrix. Nodos y circuitos integrados tratarán de proteger los datos, atacando a la representación virtual del personaje y tratando de obligarlo a cerrar la sesión del sistema.