Sinopsis:
En el fondo del mar, en un profundo complejo bajo el agua, una mujer se despierta dentro de un sarcófago criogénico sin recuerdos. Ella es recibida por la voz de Jacob, un misterioso guía que revela fragmentos de información sobre su situación, comunicándose con ella a través de un conjunto de dispositivos colocados en un diario. Él dice que su nombre es Anna, y que ella durmió durante más de un + siglo dentro de la cámara. Ella pronto empieza a explorar el lugar, descubriendo los restos ruinosos del Arca de la Humanidad, creados para almacenar los mayores logros de la humanidad. Ella debe explorar el entorno, resolver todos los puzzles para abrir nuevos caminos y descubrir todos los secretos del lugar, así como detalles sobre su pasado.
¨Empress of the Deep: El Secreto Más Oscuro¨ es una tradicional aventura de apuntar y hacer clic al estilo de ¨Myst¨ y otros juegos, pero con retos de objetos ocultos y rompecabezas sencillos hechos a medida para el mercado casual. El jugador se mueve entre escenas haciendo clic en los puntos de salida, por lo general colocados en los bordes de la pantalla o en lugares obvios, como puertas y otras aberturas. El cursor sensible al contexto cambia a una flecha cuando se llega a una salida, en una mano para recoger objetos y una lupa cuando se está en un lugar donde se puede hacer zoom mostrando otro ángulo de la escena. Herramientas útiles se encuentran dispersas en todo los lugares, y se almacenan automáticamente en una de las ranuras de inventario en la parte inferior después de ser recogidas, desde donde se pueden arrastrar y soltar en partes lógicas del escenario para llevar a cabo una acción o completar una tarea. Escenas donde todo esta recopilado y completado están marcadas con una estrella de oro ¨Área Completada¨ en la esquina superior izquierda.
En algunos lugares, la escena tiene secciones de buscar y encontrar donde el objetivo es encontrar y hacer clic en todos los objetos enumerados en la parte inferior, en las pantallas llenas de artículos varios repartidos por la zona. Después de recoger todos los elementos, uno de los objetos se almacena en el inventario para su posterior utilización en la resolución de puzzles. Minijuegos aparecen al hacer clic en determinados lugares, apareciendo dentro de las ventanas interactivas donde un mecanismo tiene que ser manipulado para resolver una miríada de desafíos, como una variación de la Torre de Hanoi con engranajes, rompecabezas, un rompecabezas con haces de luz y espejos deflectores, y otros juegos similares.
