El juego básicamente cubre la totalidad de la Saga East Blue, a partir del arco Romance Dawn y terminando con el arco Loguetown. Los jugadores controlan a Luffy a través de la totalidad del juego, a medida que se abren camino a través de las etapas, enfrentándose contra los piratas genéricos, infantes de marina y secuaces. Luffy comienza con un par de movimientos a su disposición, pero a medida que el juego avanza, gana cada vez más en su arsenal para ayudar a derrotar a sus enemigos. Otros miembros de su tripulación como Zoro, Nami y Sanji también se pueden manejar en forma de breves invocaciones, ya sea ayudando a eliminar a los enemigos o apoyando a Luffy de alguna otra manera (por ejemplo, Sanji puede cocinar para Luffy una comida que lo restaurará a la plena salud). Fiel a su estilo dentro de la serie, los jefes se ponen más difíciles a medida que el jugador avanza y se enfrenta contra los jefes que el jugador debe superar para derrotarlos.