En el decimoctavo cumpleaños de Amy, se puso en marcha el inicio de una serie de aventuras. Un desconocido entra en su casa de Londres, dejando tras de sí un ataúd curioso en su ático. En él, ella descubre una runa mágica que la teletransporta a una tierra mágica creada por las hadas: Zanzarah. En Zanzarah, el extraño desconocido se revela como un duende. El duende solicita su ayuda, ya que él cree que es la profetizada Maestra de Hadas cuyo deber es salvar a Zanzarah, puesto que la tierra está siendo devastada por las hadas salvajes, duendecillos y elfos oscuros. Amy, ahora una extraña en una tierra extraña, con la ayuda y asesoramiento de los elfos, enanos, búhos, y duendes locales, debe tratar de convertirse en una Maestra de Hadas con la captura y la formación de las hadas, participando en duelos y derrotando a las hadas salvajes y sus maestros en el camino, para cumplir finalmente su destino de salvar Zanzarah! En ¨Zanzarah: The Hidden Portal¨, juegas en el papel de Amy y debes ayudarla a convertirse en una Maestra de Hadas. Para ello, el jugador debe obtener y entrenar un hada. Con la ayuda de los habitantes locales de Zanzarah, Amy explorará la tierra en una perspectiva en tercera persona en busca de diferentes tipos de hadas que derrotar y captura, mientras que ayuda a la gente de Zanzarah en el camino.