Teniendo lugar en el planeta natal de los Transformers, Cybertron, ¨Transformers: La Guerra por Cybertron¨ cuenta la historia de los Transformers mucho antes de que entraran en contacto con la Tierra, un evento que había sido explorado anteriormente en los juegos basados ​​en las películas de 2007 y 2009. En ¨Transformers: La Guerra por Cybertron - Decepticons¨ los jugadores pueden jugar como sus personajes favoritos Decepticon y luchar como el arma definitiva, transformando en cualquier momento entre vehículo y robot y enfrentándose contra los enemigos que golpean con la potencia de fuego futurista. Al igual que la versión de consola hay campaña lineal de misiones, siguiendo básicamente la misma historia. Hay un modo de Arena con cinco ¨arenas¨, cada uno con seis misiones disponibles, cuatro niveles de bonificación de juego contrario, y siete niveles multijugador. Hay dos versiones de DS del juego, esta y la versión ¨Autobots¨. Para desbloquear todos los 30 Transformers jugables en total, incluyendo 11 exclusivos para DS, los jugadores deben derrotar a los amigos en enfrentamientos multijugador versus para ganar sus personajes.