Como una extensión de una de las más largas series de televisión de todos los tiempos, "The X-Files: El Juego" nos mete a través de los ojos del agente especial Craig Willmore, un nuevo investigador del FBI contratado para localizar a los agentes desaparecidos Fox Mulder y Dana Scully, cuya última ubicación era el área de Everett, Washington. En esta producción de vídeo con "calidad de película", los personajes son interpretados por los actores y actrices de la serie, incluyendo Gillian Anderson (Scully) y David Duchovny (Mulder). Al comenzar el juego, se te da una sesión informativa de la misión. Recoge todas las herramientas de la técnica del espionaje (gafas de visión nocturna, una cámara digital, PDA, ganzúas, kit de pruebas, un revólver edición estándar, las manillas y la placa) y luego sal a seguir su rastro. Al explorar los distintos lugares, toma fotografías, recoge piezas de evidencias y habla con la gente. Usa tu Newton PDA para acceder al mapa de navegación, para tomar notas y enviar / recibir correo electrónico. Rastrea los números de teléfono, verifica los antecedentes y identifica las matrículas e incluso publica un boletín sobre las personas desaparecidas utilizando la red de computadoras en tu hogar u oficina. Mediante el uso de software de visualización de fotos, descarga fotografías de campo para el equipo en el que se pueden ampliar y estudiar más de cerca en busca de pistas. Las características incluyen iconos de emoción para intercalar diferentes tonos durante las conversaciones (medio, buen humor o técnico) que afectan a la respuesta dada. Un sistema de pistas en el juego, y la inteligencia artificial, se pueden ajustar o desactivar. Además, hay múltiples finales, como resultado directo de las acciones que toma.